In Jelly Wars is het de bedoeling om je tegenstander te vernietigen door jelly shots op hem te schieten of op de balk onder je tegenstander om deze te laten vallen. Hoe dichter een jelly shot in de buurt komt van je tegenstanders, hoe zwakker je tegenstander wordt.
Je kunt je eigen positie tegenover je tegenstander veranderen door te springen.
Het spel speel je online tegen tegenstanders vanuit de hele wereld. Je werkt om de beurten zodat je elke beurt van positie kan veranderen en jelly shots naar de andere kant kan schieten.
